Согласно действующему законодательству нельзя одновременно применять УСН и общий режим налогообложения. Такое пояснение содержится в письмах Минфина России от 8 сентября 2015 года № 03-11-06/2/51596, от 18 марта 2013 года № 03-11-12/33 и от 1 августа 2011 года N 03-11-10/48.

Применение УСН является альтернативой общему режиму налогообложения и одновременное применение этих налоговых режимов, в том числе в отношении различных видов деятельности, недопустимо.

Поскольку каждый из этих режимов применяется в отношении всей деятельности, которую ведет налогоплательщик, а не отдельных ее видов (п. 1, 3 ст. 346.11 НК РФ).

Поэтому совмещать "упрощенку" и общую систему нельзя. Аналогичного мнения придерживаются и судьи (определение Конституционного Суда РФ от 16 октября 2007 г. № 667-О-О, постановление Арбитражного суда Волго-Вятского округа от 18 февраля 2015 года по делу № А29-2035/2014).

Мы рекомендуем организациям и предпринимателям быть внимательными в этом вопросе. Возможно, вашу деятельность можно перевести на какой-либо из данных режимов налогообложения, конечно, если он введен в вашем регионе и деятельность подпадает под него.

Если же вам важно разграничить виды бизнеса именно по режимам общей системы и УСН, по нашему мнению,лучше выделить новую деятельность в самостоятельную организацию. То есть зарегистрировать на нее отдельную фирму. Тогда в отношении каждой формы бизнеса будет применяться своя система налогообложения и совмещения не будет.